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50×Denhardt's 溶液配制指南(500 mL)
发布时间:2026-07-16 点击数:0

50×Denhardt's 溶液配制指南(500 mL)

概述

Denhardt's溶液是Southern Blot、Northern Blot等膜杂交实验中预杂交液和杂交液的重要封闭组分,由三种大分子聚合物——Ficoll 400、PVP-40(聚乙烯吡咯烷酮)和BSA(牛血清白蛋白)组成。

各组分功能

  • Ficoll 400:高分子量蔗糖聚合物,提供渗透压支持并占据膜上的非特异性结合位点

  • PVP-40:合成聚合物,覆盖膜表面疏水区域,减少非特异性吸附

  • BSA:蛋白质封闭剂,占据膜上的蛋白质结合位点,降低背景信号

三种组分协同作用,有效封闭硝酸纤维素膜或尼龙膜上的非特异性DNA/蛋白质结合位点,显著降低杂交背景,提高信噪比。

本品为500 mL规格的50倍浓缩液,使用时稀释至1×或5×工作浓度。由于BSA的热不稳定性和易污染特性,不可高压灭菌,须过滤除菌并分装-20℃保存

所需材料(无核酸酶级别)

材料规格用量
Ficoll 400分子生物学级5 g
PVP-40(聚乙烯吡咯烷酮,MW 40,000)分子生物学级5 g
BSA(牛血清白蛋白,组分V)分子生物学级,无核酸酶5 g
去离子水无核酸酶(DEPC处理或灭菌)定容至500 mL
0.45 μm滤器无菌,无核酸酶1个

详细操作流程

第一步:称量
称取5 g Ficoll 4005 g PVP-405 g BSA,置于500 mL烧杯中。BSA粉末易扬尘,操作时轻缓,避免吸入。

第二步:加水溶解
加入约400 mL无核酸酶去离子水。使用磁力搅拌器温和搅拌至所有组分完全溶解。BSA溶解较慢(约需30分钟至1小时),溶液应呈浅黄色透明(正常BSA色泽),无可见颗粒。避免剧烈搅拌(防止起泡和蛋白变性)。

第三步:定容
用无核酸酶去离子水定容至500 mL,充分混匀。

第四步:过滤除菌
使用0.45 μm滤器过滤除菌,收集滤液于无菌无核酸酶容器中。

第五步:分装
按单次实验用量分装(推荐25 mL/份,与制备100 mL杂交液配套使用),标注配制日期、浓度和保质期。

第六步:保存
-20 ℃避光保存。取用后剩余部分不可重新冻存(反复冻融导致BSA变性和聚集)。

重要——保存与稳定性

保存条件稳定性说明
-20 ℃长期稳定(>1年)推荐保存方式,分装后避免反复冻融
4 ℃短期(数天至1周)易滋生细菌,BSA可能降解
室温不推荐(数小时)BSA易变质,不推荐室温保存

⚠️ 变质判断标准:若溶液出现浑浊、絮状沉淀、白色颗粒或异味,说明已污染或蛋白变性,须废弃,不可使用

Denhardt's溶液在杂交实验中的作用机制

在Southern/Northern Blot的预杂交和杂交步骤中,标记探针不仅会与固定在膜上的靶核酸结合,还可能非特异性吸附于膜表面。Denhardt's溶液通过以下机制封闭非特异性位点:

组分作用机制
Ficoll 400大型聚合物分子,空间位阻效应,占据膜上非特异性核酸结合区域
PVP-40合成聚合物,与膜表面疏水区域结合,减少探针的非特异性疏水吸附
BSA蛋白质分子,占据膜上的蛋白质结合位点,封闭离子交换位点

三者协同后,膜上的非特异性结合位点被完全占据,标记探针只能与靶核酸进行特异性杂交,从而实现低背景、高信噪比的检测结果。

配制问题与解决方案

问题原因解决方法
BSA溶解缓慢BSA为蛋白质,溶解动力学慢温和搅拌30~60分钟,避免加热(加热易致BSA变性)
溶液浑浊或有絮状物BSA变质或原料不纯使用新鲜、高质量的BSA(组分V,无核酸酶),若配制后仍浑浊则废弃
过滤速度极慢溶液中含有未完全溶解的大分子聚集体延长搅拌时间确保完全溶解,再行过滤
过滤后溶液仍浑浊蛋白变性或微生物污染废弃,重新配制(检查BSA质量和水的洁净度)
保存后出现沉淀反复冻融或微生物污染若沉淀不可逆,则废弃;后续注意分装使用,避免反复冻融
杂交背景过高Denhardt's浓度不足或BSA降解增加Denhardt's用量或使用新鲜配制的溶液

在杂交液中的稀释使用指南

50×Denhardt's为浓缩储备液,使用时稀释至工作浓度:

典型工作浓度(杂交液配方)

应用工作浓度50×Denhardt's用量(以100 mL杂交液计)
DNA杂交(Southern)10 mL
RNA杂交(Northern)10 mL
高严谨性杂交1×~2×2~4 mL

常见杂交液配方(参考)

组分用量
20×SSC(或SSPE)30 mL
50×Denhardt's10 mL
10% SDS5 mL
10 mg/mL Salmon DNA1 mL
去离子水54 mL
总计100 mL

关键操作要点

  1. 无核酸酶是底线:所有器具、耗材、水须经无核酸酶(RNase/DNase-free) 处理。Denhardt's溶液一旦被核酸酶污染,将直接影响探针和靶核酸的完整性。对于Northern Blot,RNase污染会直接导致RNA靶标降解,实验失败。

  2. 不可高温高压灭菌:BSA在121 ℃高压下会不可逆变性沉淀。灭菌必须通过0.45 μm滤器过滤实现

  3. 避免反复冻融:反复冻融会造成BSA聚集沉淀,降低封闭效率。建议按单次实验用量小份分装(如25 mL/份),每次取用一份,剩余部分不可放回-20℃再冻存。

  4. BSA质量决定成败:推荐使用分子生物学级BSA(组分V) ,确保无DNase/RNase/蛋白酶活性。劣质BSA可能含核酸酶杂质,导致探针降解。

  5. 过滤膜材质选择:使用低蛋白结合的PES或CA材质滤器,避免BSA被滤膜非特异性吸附导致浓度损失。避免使用尼龙膜材质的滤器(BSA会吸附于尼龙)。

  6. 溶液颜色参考:正常的Denhardt's溶液因BSA的存在呈微黄色至浅黄色透明状(BSA的天然色泽)。若颜色深黄或呈棕色,说明BSA已氧化或变质,应废弃。

  7. 取用规范:每次取用时使用无菌无核酸酶枪头,避免交叉污染。

应用场景

应用说明
Southern Blot预杂交液/杂交液中的封闭剂(DNA杂交)
Northern Blot预杂交液/杂交液中的封闭剂(RNA杂交)
菌落/噬菌斑杂交膜上非特异性结合位点封闭
Dot/Slot Blot点杂交封闭处理
原位杂交(ISH)组织切片或细胞杂交中的封闭成分


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