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DNase I溶液:从储存液到工作液,配错一步全白做
发布时间:2026-07-25 点击数:1

DNase I溶液:从储存液到工作液,配错一步全白做

做RNA实验最怕什么?提完RNA跑胶一看,28S和18S条带倒是清晰,但基因组DNA的条带也明晃晃地在那里。qPCR内参Ct值异常、反转录效率忽高忽低——所有问题都指向同一个根源:你的RNA样本里混进了基因组DNA。

DNase I处理是解决这个问题的“标准答案”。但DNase I本身的配制,却让不少实验者栽了跟头。买来的干粉不会配、储存液和工作液搞混、反复冻融导致酶活大幅下降——每一步都可能出错。

本文把储存液与工作液的分层逻辑、不同产品形态的配制方案、操作关键点拆透——帮您一次配对,不再翻车。

一、核心参数一览

参数内容
中文名称脱氧核糖核酸酶I(DNase I)
英文名称Deoxyribonuclease I
来源牛胰腺(最常见)
分子量~31 kDa
最适pH~7.0–8.0
活性依赖二价阳离子(Mg²⁺或Mn²⁺)——无金属离子,无活性
抑制剂EDTA、EGTA、SDS、金属离子螯合剂
灭活方式EDTA螯合(终浓度2.5 mM)或65°C加热10分钟

二、储存液 vs 工作液——先搞清楚这两个概念

DNase I的配制分为储存液工作液两个层级,两者不能混用:

层级用途特点
储存液长期保存高浓度、含甘油防冻保护、-20°C保存
工作液上样消化临用现配、稀释至使用浓度、不含EDTA
核心原则储存液是“原料”,工作液是“耗材” 。每次消化前需要将储存液稀释成工作液,切勿将工作液重新冻回储存。

三、配制前的关键决策——先看产品形态,再选方案

市面上DNase I产品的形态主要有三种,不同形态的配制逻辑完全不同:

产品形态常见品牌/来源你需要做什么
冻干粉天根(RT411)、Thermo Fisher、Sigma溶解配制成储存液,再稀释为工作液
高浓度甘油储存液(已配制好)GoldBio、NEB部分产品无需配制储存液,直接取用稀释为工作液
即用型液体(低浓度,无甘油)部分试剂盒配套直接使用,无需任何配制
⚠️ 特别提醒:冻干粉有时会形成一层透明薄膜贴在瓶壁上,肉眼看起来像是空的——请不要误以为瓶子是空的而丢弃或打开瓶盖,造成损失

冻干粉的两种溶解逻辑

如果买到的是冻干粉,溶解时有两种方案可选——水溶法(无甘油)和甘油保护法(含甘油),两者保存期限完全不同:

溶解方案溶剂保存温度有效期适用场景
水溶法RNase-Free ddH₂O-20°C冻存9个月(-20°C);6周(4°C)干粉复溶、短期使用
甘油保护法含50%甘油的缓冲液-20°C(不结冰)长期(避免反复冻融即可)高浓度酶液长期保存

四、常用储存液配制方案一览

以下是多方来源验证的DNase I储存液配制方案

方案储存液溶剂/缓冲液关键添加剂参考浓度保存条件来源/适用场景
方案一(水溶法)RNase-Free ddH₂O~2.7 U/μL(1500 U/550 μL)-20°C 9个月;4°C 6周天根DNase I干粉(RT411)
方案二(Tris+甘油+Mg²⁺)20 mM Tris-HCl(pH 7.5)50%甘油 + 1 mM MgCl₂≥2 mg/mL-20°CSigma推荐方案
方案三(Tris+甘油+NaCl)20 mM Tris(pH 7.5)50%甘油 + 50 mM NaCl20,000 U/mL-20°C分装PMC文献,用于DNase I足迹实验
方案四(Tris+甘油+CaCl₂)10 mM Tris-HCl(pH 7.6)50%甘油 + 2 mM CaCl₂-20°C部分商品化储存方案
方案五(稀HCl+甘油法)0.0025 N HCl50%甘油2 mg/mL-20°CCSH Protocols经典配方

⚠️ 关于方案五(稀HCl法)的重要说明

CSH Protocols推荐的稀HCl溶解法是经典方法,稀HCl本身对DNase I活性没有影响。但如果后续要将该储存液用于RNA样品的消化处理,且担心极微量酸残留可能对RNA有潜在影响,可改用10 mM Tris-HCl(pH 7.5)代替0.0025 N HCl进行溶解——两者均可获得活性良好的DNase I储存液。

为什么甘油能保护DNase I?

DNase I在反复冻融过程中容易失活。加入50%(v/v)甘油后,溶液在-20°C不会结冰,可以避免冰晶损伤酶蛋白结构,同时保持酶活性稳定。

五、配制步骤——以天根DNase I干粉(1500 U)为例

步骤操作关键要点
1准备RNase-Free ddH₂O、无菌枪头所有接触DNase I的耗材必须RNase-Free
2用RNase-Free注射器吸取550 μL RNase-Free ddH₂O
3将水注入DNase I干粉瓶中干粉有时会形成透明薄膜贴壁,肉眼看似空瓶——确认有粉,再操作
4轻柔颠倒混匀至完全溶解禁止涡旋振荡——DNase I是蛋白质,剧烈振荡会变性失活
5分装成小份(20–50 μL/管),-20°C冻存建议按单次使用量分装,避免反复冻融

融化后的储存液怎么处理?

从-20°C取出的DNase I储存液融化后,应置于4°C保存(可保存6周),不要再次冻存。反复冻融是DNase I失活的最常见原因。

六、工作液的配制

工作液临用现配,配制后立即使用,不可保存。

方案A:天根柱式RNA提取方案(以天根试剂盒为例)

每个样品取 10 μL DNase I储存液,加入 70 μL Buffer RDD(天根试剂盒配套的即用型缓冲液),轻柔混匀

注意:Buffer RDD是天根试剂盒专用缓冲液,非通用试剂。如使用其他品牌试剂盒,请按该品牌说明书配制工作液。

方案B:通用工作液配制逻辑

组分用量说明
DNase I储存液按实验需求根据目标DNA量和酶活计算
反应缓冲液(含Mg²⁺)补足至终体积必须含二价阳离子不能含EDTA
关键:工作液和反应缓冲液中不能含有EDTA——EDTA会螯合掉Mg²⁺,使DNase I完全失活

七、五个实验党必看的操作关键点

① 金属离子是“启动开关”

DNase I的活性严格依赖Mg²⁺或Mn²⁺。反应体系中必须含有这些二价阳离子,否则酶“有劲使不出”。

Mg²⁺存在时,DNase I在双链DNA的每条单链上随机产生切口;Mn²⁺存在时,可在同一位点切断DNA双链

② EDTA是“终止按钮”

要终止DNase I反应,有以下几种方式(按推荐优先级排序):

优先级终止方式适用场景注意事项
首选柱式纯化所有RNA样品同时去除DNase I和DNA片段,最彻底、最安全
次选65°C加热10分钟对热稳定RNA高温可能导致部分RNA降解
末选加EDTA至终浓度2.5 mM后续需保持RNA完整性EDTA会螯合反转录所需的Mg²⁺,后续需补加Mg²⁺

③ 融化的储存液不要再冻回去

  • 从-20°C取出的储存液融化后,应置于4°C保存(可保存约6周) ,不要再次冻存

  • 反复冻融是DNase I失活的最常见原因——这也是为什么建议分装成小份后冻存

④ DNase I ≠ RNase-Free DNase I

  • 普通DNase I可能含有RNase污染,用于RNA样品处理时务必选择“RNase-Free”级别的DNase I

  • 不要拿实验室自配的普通DNase I去处理RNA样品

⑤ 用量参考——注意不同厂家的单位定义不同

不同厂家对DNase I活力单位的定义不完全相同

品牌/来源1 U 的定义
Sigma37°C、pH 7.0,10 min完全降解1 μg质粒DNA
Kunitz单位25°C、pH 7.0,1 min使λDNA的A₂₆₀增加0.001
天根以产品说明书为准

建议

一般1 U DNase I可消化<1 μg DNA

不同厂家单位定义不同,更换品牌时务必以新品牌说明书为准

首次使用某品牌产品时,建议做预实验优化用量

八、常见问题速查

问题原因解决方案
DNase I处理后有DNA残留①酶量不足
②反应时间不够
③缓冲液含EDTA抑制酶活性
①增加酶量
②延长消化时间
③检查缓冲液配方
DNase I处理后RNA降解使用的DNase I含RNase污染换用RNase-Free级别DNase I
反复冻融后活性下降冻融损伤酶蛋白分装冻存,每管单次用量
储存液融化后又冻回去操作不当已融化应置于4°C保存,6周内用完
不知道自己的产品该配成多少浓度未确认产品形态看试剂瓶标签——是冻干粉还是甘油溶液?按标签说明操作

九、商业化即用型产品的价值

DNase I实拍图.jpg

厂家联系微信号:19850855600

邮箱:support@fwkbio.com

官网链接:DNase I-杭州富沃克生物科技有限公司

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参考文献

[1] 天根生化. DNase I(RNase-Free)产品说明书(RT411). —— 用于DNase I干粉溶解方案:1500 U干粉溶于550 μL RNase-Free ddH₂O;-20°C保存9个月,融化后4°C可保存6周;禁止涡旋振荡

[2] STAR Protocols. 2022 Dec 9;3(4):101914. doi:10.1016/j.xpro.2022.101914. —— 用于Tris+甘油+NaCl储存液配方:20 mM Tris pH 7.5,50%甘油,50 mM NaCl,20,000 U/mL

[3] GoldBio. DNase I Stock Solution for Protein Purification. —— 用于Tris-HCl+甘油法储存液配制

[4] DNase I Solution (10 mg/mL). Cold Spring Harbor Protocols, 2024. —— 用于稀HCl+甘油配方(0.0025 N HCl + 50%甘油)及纯水法。

[5] Sigma-Aldrich. DNase I from bovine pancreas. —— 用于Sigma单位定义(37°C、pH 7.0,10 min完全降解1 μg质粒DNA)

[6] DNase I OmniPur® Grade. Sigma-Aldrich. —— 用于甘油保护法配方:20 mM Tris-HCl pH 7.5,50%甘油,1 mM MgCl₂

[7] 重组DNase I(RNase Free)产品信息. —— 用于10 mM Tris-HCl pH 7.6,2 mM CaCl₂,50%甘油储存液配方

[8] DNase I(不含RNase)产品说明. Biomart. —— 用于RNase-Free DNase I的用途说明

[9] DNase I反应终止方法. Coolaber. —— 用于EDTA终止(终浓度2.5 mM)及65°C加热10分钟灭活


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